Arthrotec kullanırken bazı yan etkiler görülebilir. En sık görülenler mide ve bağırsakla ilgilidir: mide ağrısı, ishal, mide bulantısı, hazımsızlık. İshal genellikle hafiftir ancak şiddetliyse veya devam ederse doktorunuza danışın. Mide koruyucu etkisi olsa da, nadiren mide veya bağırsak ülseri, kanama veya delinme riski olabilir. Bu durumda hemen ilacı bırakıp doktorunuza başvurmalısınız. Daha az görülen yan etkiler arasında baş ağrısı, baş dönmesi, döküntü, kaşıntı, karaciğer fonksiyon testlerinde değişiklikler sayılabilir. Çok nadiren ciddi reaksiyonlar (örn. şiddetli deri reaksiyonları, alerjik reaksiyonlar, kalp krizi, felç, böbrek yetmezliği) görülebilir. Bu gibi belirtiler fark ederseniz derhal tıbbi yardım alın. Eğer ilacı kullanmaya başladıktan sonra vücudunuzda beklenmedik bir reaksiyon fark ederseniz mutlaka doktorunuza danışın.
En sık görülen yan etkiler gastrointestinal sistemle ilgilidir: mide ağrısı, diyare, bulantı, dispepsi, gastrit. Nadiren mide/bağırsak ülseri, perforasyon veya kanama görülebilir. Diğer yaygın yan etkiler baş ağrısı, baş dönmesi ve deri döküntüsüdür. Daha az sıklıkla hepatik fonksiyon testlerinde anormallikler, ödem, hipertansiyon görülebilir. Çok seyrek olarak ciddi kardiyovasküler olaylar (miyokard infarktüsü, inme), böbrek yetmezliği, hepatik yetmezlik ve ciddi deri reaksiyonları (örn. Stevens-Johnson sendromu, TEN) bildirilmiştir. Ciddi Gİ kanama veya perforasyon, mide/bağırsak ülseri şüphesi varsa tedavi derhal kesilmelidir. Aseptik menenjit, anafilaktoid reaksiyonlar bildirilmiştir. Kan ve lenf sistemi bozuklukları (trombositopeni, lökopeni, aplastik anemi, agranülositoz) görülebilir.
